تبلیغات
Animalscience - ژنتیک
 
Animalscience
دارای بالاترین آمار بازدیدها در بین وبلاگهای علمی در ایران
جمعه 15 شهریور 1392 :: نویسنده : حمیده شیخ زین الدین

تنوع ژنتیکی

ژنتیك جمعیت

به بررسی ساختار ژنتیكی جمعیت و به عبارت دیگر به فراوانی های ژنی و ژنوتیپی و قوانین حاكم بر تغییرات آنها می پردازد. ژنتیك جمعیت علم مطالعه تنوع ژنتیكی در جمعیت هاست. این علم تنوع حاصل از عواملی همچون انتخاب، جهش، نوتركیبی، جریان تصادفی ژنی و اندازه موثر جمعیت را پیش بینی می كند( pirchner, 1983، Mburu, 2005).

 

ضرورت بررسی تنوع ژنتیكی

مقدار و ماهیت تنوع ژنتیكی در یك جمعیت جهت برآورد موارد زیر كاربرد دارد

(Mburu, 2005).

1- اندازه موثر جمعیت

2- گذشته جمعیت(مهاجرت، اثر bottleneck، توسعه اخیر)

3- ساختار جمعیت

4- چگونگی اثر انتخاب بر ژنها

5- تعیین جایگاه ژنی صفات كمی

 

انواع تنوع ژنتیكی

1- تنوع فنوتیپی(فیزیكی)

2- تنوع كروموزومی(كاریوتایپ)

3- تنوع ایمونولوژیكی (گروههای خونی و ....)        

4- تنوع پروتئینی (آنزیم ها)

5- تنوع در سطح DNA(چندشكلی توالی های DNA)

(Mburu, 2005).

 

تنوع مولكولی یا چند شكلی

شامل موارد زیر است:

1- تغییر درنوكلئوتیدها(transversion or transition)

2- اضافه شدن یا حذف نوكلئوتیدها(indel)

3- تنوع در تعداد تكرارهای توالی های تكرارشونده پشت سرهم(Satellites)

(Mburu, 2005).

 

معیارهای سنجش تنوع مولكولی در سطح فرد یا جمعیت

1- چند شكلی: تعداد جایگاههای چند شكل با نسبت جایگاههای چند شكل به جایگاههای مورد بررسی جمعیت

2- هتروزیگوسیتی: نسبت افراد هتروزیگوت در جمعیت كه بصورت هتروزیگوسیتی مورد انتظار (H4) یا هتروزیگوسیتی مشاهده شده(H0) برآورد می شود.

3- تعدادمتوسط آللها(MNA): تعداد متوسط آللها مشاهده شده در یك جایگاه ژنی

(Mburu, 2005).

 

ماركرهای مورد استفاده برای بررسی تنوع مولكولی و فاصله ژنتیكی

1- RFLp (Restriction): در نتیجه 1- موتاسیون نقطه ای و ایجاد یا از بین رفتن محل اثر آنزیم های محدودالاثر و یا 2- indel و تغییر اندازه قطعه تحت تأثیر هضم آنزیمی چند شكلی به واسطه تفاوت در طول قطعات به وجود می آید.

2- RAPD(Randomly Amplified polymorphic DNA):

3- AFLP(Amplified fragment lengh polmorphism):

4- Mierosatellites

 5- Mt DNA

 6- SNPs

(Mburu, 2005).

 

میكروساتلایت ها

تعریف: میكروساتلایت ها توالی های كوتاه نوكلئوتیدی (معمولاً 1 تا 5 جفت باز) هستند كه پشت سر هم تكرار می شوند. آلل های میكروساتلایت به وسیله تفاوت در تعداد تكرارها مشخص می شوند. جایگاههای میكروساتلایت تحت نامهای مختلفی معرفی می شوند

.(STMS, SSLP, UNTR, SSTR, STRs, SSRs) (Mburu, 2005).

 

مثالهایی از میكروساتلایتها:

 الف: واحدهای تكرارشونده

 ب: میكروساتلایت هموزیگوس

 

ج: میكروساتلایت  هتروزیگوس

 

موتاسیون: دو مكانیسم برای موتاسیون میكروساتلایت ها وجود دارند: replication slippage و unequal crossing- over كه موجب به وجود آمدن آلل های مختلف برای یك جایگاه میكروساتلایت می شوند(Levinson and Gutman,1987).

دو مدل موتاسیونی برای موتاسیون در جایگاههای میكروساتلایت تعریف شده است(Mburu, 2005).

I) (AM) infinit allele model

II) Stepwise mutation model (SMM)

I) در این حالت تمامی جهش ها آلل جدیدی را پدید می آورند كه بیش از یك تكرار با آلل والدی تفاوت دارد.

آماره(Wright)F، تنوع ژنتیكی در جمعیت را بر همین اساس بیان می كند.

II) در این حالت جهش آلل جدید را پدید می آورد كه یك تكرار بیشتر یا كمتر از آلل والدی است.

بدین ترتیب تفاوت در اندازه آلل ها اطلاعاتی در مورد رابطه خویشاوندی اجدادی ارائه می دهد. آلل هایی با تفاوت زیاد در اندازه وابستگی كمتری به همدیگر دارند.

آماره R(Slatkin)، تنوع ژنتیكی در جمعیت را بر این اساس بیان می كند.

میزان متوسط موتاسیون میكروساتلایت ها 2-10 تا 6-10 در هر جایگاه ژنی در هر نسل می باشد.

مزایا: 1- فراوانی ژنومی بالا 2- پراكندگی تصادفی در ژنوم 3- چند شكلی بالا 4- قابلیت تكرار بالا 5- ماركر Co-dominant 6- كاربردهای وسیع و ....

چند شكلی

اصطلاحی است كه وجود اشكال مختلف را توصیف می كند. چند شكلی نشانگر تنوع ژنتیكی به ارث رسیده بوده و ابزار موثری برای ارزیابی همخونی و بررسی تغییرات جمعیت ها در طول زمان است.

یك جایگاه ژنی زمانی چند شكل است كه آلل با بیشترین فراوانی، فراوانی كمتر از 95% داشته باشد. جایگاه به شدت چند شكل زمانی وجود خواهد داشت كه فراوانی، آلل با بیشترین فراوانی، كمتر از 55% باشد(Jothi,2008 ).
http://novin-damparvaran.blogfa.com/cat-34.aspx



نوع مطلب : اصلاح دام و طیور، 
برچسب ها :
لینک های مرتبط :
 
لبخندناراحتچشمک
نیشخندبغلسوال
قلبخجالتزبان
ماچتعجبعصبانی
عینکشیطانگریه
خندهقهقههخداحافظ
سبزقهرهورا
دستگلتفکر


پیوندها
آمار وبلاگ
  • کل بازدید :
  • بازدید امروز :
  • بازدید دیروز :
  • بازدید این ماه :
  • بازدید ماه قبل :
  • تعداد نویسندگان :
  • تعداد کل پست ها :
  • آخرین بازدید :
  • آخرین بروز رسانی :